Крафт прибыл в Якутск 27 марта 1907 года. На должность губернатора утвержден именным царским указом от 28 мая 1907 года. В Якутии Крафт развивает сельское хозяйство, животноводство, ветеринарное дело, пушной промысел. В 1911 году был создан сельскохозяйственный склад, поставляющий сельскохозяйственную технику, семена и зерно крестьянам. В том же году были открыты сельскохозяйственные курсы.

  С 1 января 1913 года во всех школах Якутской области было введено преподавание основ сельскохозяйственных знаний. В области открывается 228 хлебных магазинов и 41 рыбный магазин. С сентября 1912 года в Якутске начинают проводиться ежегодные сельскохозяйственные выставки. С 1912 года издаётся сельскохозяйственный журнал «Якутское хозяйство». В 1910 году был создан первый потребительский кооператив. Всего во время губернаторства И. И. Крафта, с 1910 по 1916 гг. было открыто 43 потребительских общества. Для защиты ценных зверей и птиц от уничтожения губернатор ввёл ограниченные сроки охоты. На добычу соболя был объявлен трехлетний запрет. Были приняты меры по упорядочению рыболовства в низовьях Лены.

Крафт развивает торговлю, поощряет купцов и предпринимателей. В Якутске открывается отделение Русско-азиатского банка, городской общественный банк Н. Д. Эверстова. Растёт добыча золота в верховьях Лены, на реках Олёкме, Алдане, Вилюе, свинца — в Верхоянье, соли — на Западном Вилюе. На прииски поставляется сельскохозяйственная продукция, лес, сено, скот и другие товары. По Лене открылось почтово-пассажирское пароходное движение. Если в начале XX века Ленский флот имел всего 11 пароходов, то в1917 году флот вырос до 38 грузовых пароходов и 113 барж. И. И. Крафт предлагал соединить Якутию с Транссибирской магистралью. Строительство Амуро-Якутской магистрали началось только в 1985 году. Во время губернаторства Крафта было проведено статистико-географическое обследование области, исследовано более 2200 хозяйств во всех улусах, все населённые пункты были нанесены на карту. Крафт в 1907 году организовал геологическую экспедицию в Сунтарский район (Кемпендяй), в 1911 году Тимптонскую экспедицию для изыскание скотогонного пути на золотые прииски, Гижигинскую экспедицию изыскания направления телеграфной линии на Охотск.

Были открыты золотые россыпи, месторождения мрамора, железной руды, каменного угля, строительных материалов. По просьбе Крафта Совет Русского географического общества26 августа 1913 года открыл Якутский отдел РГО. В области были открыты приюты для слепых, глухих и умалишенных, строились больницы и фельдшерские пункты. С 1906 по 1914 год в области количество больниц выросло на 63 %, врачей на 73 %, фельдшеров — в три раза. В Якутии появились телефон, телеграф, кинематограф, электричество. В Якутске начали строить каменные здания: двухэтажное здание музея-библиотеки, здание окружного суда, казначейства и другие. В городе разбили сквер с фонтаном, который был назван в честь губернатора, сквером И. Крафта. Число начальных школ увеличилось за шесть лет до 17. Были открыты педагогические курсы для учителей, построено двухэтажное каменное здание реального училища и женской гимназии. Всего в области учились 2179 человек. И. И. Крафт организовал 26 стипендий.

На обучение детей бедных якутов выделялось ежегодно от 2000 до 3000 рублей. По предложению Крафта Академия наук издала словари якутского языка, составленные Э. К. Пекарским. И. И. Крафт способствовал развитию независимой прессы, улучшал условия содержания заключённых и условия жизни ссыльных. Из-за этого имел сложные отношения с Иркутским генерал-губернатором А. Н. Селивановым. А. Н. Селиванов добился перевода И. И. Крафта на должность губернатора Енисейской губернии. 22 июля 1913 года И. И. Крафт уехал из Якутска в Красноярск. Городская дума Якутска избрала Крафта почётным гражданином Якутска. Учащимся вузов, родившимся в Якутии, были установлены стипендии имени Крафта. Городская Дума присвоила одной из улиц города имя губернатора Крафта. Было решено поместить его портрет в читальном зале городской библиотеки. В октябре 2001 года в Якутске на площади Дружбы был установлен памятник губернатору И. И. Крафту. 
Материал из Википедии — свободной энциклопедии 

Личная жизнь «маленького Сперанского» 

21 ноября 1914 года в городе на Неве скончался экс-губернатор Якутской области Иван Крафт - человек, которого у нас очень ценили и любили. И даже называли «маленьким Сперанским»! За шесть лет руководства областью он проехал на лошадях, оленях и собаках свыше 10 тысяч верст, объезжая округа и хозяйства. Два раза в неделю Крафт принимал граждан по личным вопросам. Первым из якутян, кто стал собирать материалы для биографического очерка об Иване Ивановиче, был инспектор народных училищ Кузьма Атласов. «Я против своей биографии! - всегда говорил Крафт - Пусть история расценит меня...». Заслуг губернатора великое множество, всех перечислить невозможно. Кстати, личная жизнь руководителя области не сложилась. Его первая жена умерла в Оренбурге, и он очень переживал эту потерю. Второй раз Крафт женился на дочери генерал-майора, выпускнице Смольного института благородных девиц Вере Эммануэль. Венчание состоялось 21 апреля 1902 года. Их супружеская жизнь, как известно, не выдержала испытания временем. Она не поехала в далекий и морозный Якутск, а осталась в столице. Детей от нее, впрочем, как и от первой жены, у Крафта не было. Примерно в 1909 году Вера Александровна подала прошение на имя генерал-губернатора Иркутской области Селиванова, когда тот приехал в Питер. Дама молила подействовать на мужа.

Затем дело дошло до суда. В газете «Якутская мысль» (№25, №26 за 1909 год) сообщалось, что иск жены Крафта удовлетворен, и тот должен выплатить на содержание Эммануэль огромную по тем временам сумму — 30 тысяч рублей.

Конкин П.К.  

Статья политического ссыльного социал-демократа Н. Е. Олейникова «Из воспоминаний о И.И. Крафте», опубликованная в журнале «Ленские волны» 1915 г. 

В первые годы своего губернаторства в Якутске И. И. Крафт был большой либерал по отношению к политическим ссыльным. Все ссыльные по прибытии в Якутск оставлялись губернатором проживать в городе, и если и высылались, то самое большое за 7 верст в Марху. Доступ к И. И. Крафту был самый «общедоступный», и ссыльные осаждали его различными просьбами, не исключаю и просьб о материальной себе помощи в виде ссуд и т.п. Редко когда И. И. Крафт в чем либо отказывал просителю-ссыльному, и среди ссыльных-политиков он вскоре стал носить кличку «товарищ Иван Иванович», «Товарищ Крафт». Правда это звучало как-то странно и насмешливо, но, вскоре все к этому привыкли, и среди ссыльных подобное величание Крафта существовало до поездки его в Петроград, куда он был вызван по делам Якутской области; и приехав оттуда, резко изменил как свой курс губернаторства, так равно и свои отношения к политическим ссыльным. После этого ссыльные говори ли: «Товарищ Крафт испортился». До этой же поездки Крафт шел не редко на многие уступки ссыльным, и бывали даже такие случаи, когда в интересах поддержать «спокойствие и тишину» среди ссыльных в Якутске, он шел в разрез с министерскими циркулярами Так на пример, зимою в 1908 г. был такой случай. Из местной тюрьмы убежал один из политических ссыльных, Кошубин, которого арестовали для отправки в Россию на суд по открытому вновь делу. Кошубина в тюрьме быстро хватились, устроили по городу облаву, произвели у всех ссыльных обыски и, напав на след, поймали его в Мархе. Когда его привезли в тюрьму, то от сильного нервного потрясения он впал в каталепсическое состояние. От дельной больницы в тюремной ограде в то время не было, и Кошубина поместили в камере одного из тюремных бараков. На другой день среди политических ссыльных распространились слухи, что Кошубина при поимке и когда везли его в тюрьму, полицейские сильно избили, и от этих побоев Кошубин лежит в бессознательном состоянии в тюрьме при самых неблагоприятных условиях. В ссылке в то время существовали еще организации материальной взаимопомощи, организация для содержания библиотеки ссыльных, и по этому “ссылка” заволновалась и стала созывать собрания для обсуждения этого вопроса и вынесения той или иной резолюции. На одном из таких открытых собраний было решено проверить распространившиеся слухи и, если слухи подтвердятся, то как ни будь реагировать на действия полицейских. Но как проверить состояние здоровья Кошубина? Постановили требовать от губернатора назначения для осмотра Кошубина врачебной комиссией и до пустить в состав этой комиссии одного из ссыльных. Так как я занимался в городе медицинскою практикой и отбывал в то время ссылку, то меня ссыльные избрали в комиссию и поручили мне же переговорить с губернатором И. И. Крафтом... Ознакомив г. Крафта с характером слухов, циркулирующих среди ссыльных, и нарисовав ему картину негодования и волнения ссыльных, которые могут перейти в «вспышку» и вы звать не желательные в Якутске формы реагирования, я передал ему желание и требование ссыльных на значить врачебную комиссию с моим участием в ней как уполномоченного от ссыльных. Долго Крафт не соглашался на «та кой» со став комиссии, но не видя другого исхода, кроме репрессии к ссыльным, и в то же время боясь возможных последствий от репрессивных мер, отложил разрешение этого вопроса до вечера... Вече ром, в тот же день, часов в пять, приезжает ко мне полицмейстер г. Д. и предлагает мне ехать в тюрьму, где ждет меня губернатор. Когда я приехал в тюрьму, то там уже бы ли все в сборе: губернатор, вице-губернатор, товарищ прокурора Б., врачебный инспектор В., помощник его Г. и чиновник особых поручений. — Ну, вот и пре красно! — сказал И. И. Крафт. — Идемте осматривать Кошубина. В камере мне предоставили возможность самому исследовать и осмотреть Кошубина. Признаков побоев не было. Каталепсия же была полная. По осмотре был составлен протокол. Уходя из камеры г. Крафт, подойдя ко мне, спросил: — Теперь на верное, “ссылка” вполне удовлетворена и волноваться больше не будет?! — Да, на верное! Благодарствую! — ответил я. 
Н. Е. Олейников